1956年（当时为中国科学院科学奖金）
1、典型域上的多元复变数函数论
完成人：华罗庚
2、示性类及示嵌类的研究
完成人：吴文俊
3、工程控制论完成人：钱学森
1982年
1、人工全合成牛胰岛素研究
完成人：钮经义、龚岳亭、邹承鲁、杜雨苍，季爱雪、邢其毅，汪猷、徐杰诚
2、大庆油田发现过程中的地球科学工作
完成人：李四光、黄汲清、谢家荣、韩景行、朱大绶、吕华等
3、配位场理论研究
完成人：唐敖庆、孙家钟、邓从豪、张乾二、江元生等
4、反西格马负超子的发现
完成人：王淦昌、丁大钊、王祝翔
5、中国地质图类及亚洲地质图
完成人：王晓青、楚旭春、黄汲清、郭文魁、程裕淇、王曰伦等
6、哥德巴赫猜想研究
完成人：陈景润、王元、潘承洞
7、《中国科学技术史》
完成人：李约瑟等（英国剑桥大学李约瑟研究所）
1987年
1、青藏高原隆起及其对自然环境与人类活动影响的综合研究
完成人：刘东生、施雅风、孙鸿烈、郑度、常承法、吴征镒等
2、微分动力系统稳定性研究
完成人：廖山涛（北京大学）
3、东亚大气环流
完成人：叶笃正、陶诗言、朱抱真、陈隆勋
4、分子轨道图形理论方法及其应用
完成人：唐敖庆、江元生
5、酵母丙氨酸转移核糖核酸的人工全合成
完成人：王德宝、汪恩璧、汪猷、郑可沁、朱莹书、陈海宝等
6、蛋白质功能基团的修饰及其生物活性之间的定量关系
完成人：邹承鲁、许根俊、孙玉琨、杜雨苍、赵康源、周海梦
7、中国高等植物图鉴及中国高等植物科属检索表
完成人：王文采、汤彦承及其研究集体
8、中国古代建筑理论及文物建筑保护的研究
完成人：梁思成、林徽因、莫宗江、徐伯安、楼庆西、郭黛娅
9、五次对称性及Ti－Ni准晶相的发现与研究
完成人：郭可信、叶恒强、李斗星、张泽、王大能
10、中国层控矿床地球化学
完成人：涂光炽、王秀璋、陈先沛、张宝贵、杨蔚华、程家平等
11、关于不相交STEINER三元系大集的研究
完成人：陆家羲（内蒙古包头市第九中学）
1989年
1、液氮温区氧化物超导体的发现
完成人：赵忠贤、杨国桢、陈立泉、杨乾声、黄玉珍及其研究集体
2、基于时序逻辑的软件工程环境的理论与设计
完成人：唐稚松（中国科学院软件研究所）
1991年
（空缺）
1993年
中国蕨类植物科属的系统排列和历史来源
完成人：秦仁昌（中国科学院植物研究所）
1995年
（空缺）
1997年
哈密尔顿系统的辛几何算法
完成人：冯康等
1999年、2000年、2001年（空缺）
2002年
有机分子簇集和自由基化学的研究
完成人：蒋锡夔、计国桢等
2003年
澄江动物群与寒武纪大爆发
完成人：侯先光，陈均远，舒德干
2004年
（空缺）
2005年
（空缺）
2006年
1、介电体超晶格材料的设计、制备、性能和应用
完成人：闵乃本、朱永元、祝世宁、陆亚林、陆延青
2、金属配合物中多重键的反应性研究
完成人：支志明
2007年
空缺
2008年
空缺
2009年
“《中国植物志》的编研
十位主要完成人：植物所：钱崇澍、王文采、陈艺林、陈心启、崔鸿宾；华南植物园：陈焕镛、胡启明；昆明植物所：吴征镒院士、李锡文；、中山大学：张宏达
《中国植物志》是目前世界上最大型、种类最丰富的一部巨著，全书80卷126册，5000多万字，9000多幅图。记载了我国301科3408属31142种植物的科学名称、形态特征、生态环境、地理分布、经济用途和物候期等。该书由全国60余家科研教学单位的312位作者（其中中国科学院院士10位）和164位绘图人员经80年的工作积累，45年艰辛编撰才得以最终完成。这一协作的规模在世界上也是十分罕见的。
2010年
空缺
2011年
空缺
2012年
空缺
2013年
40K以上铁基高温超导体的发现及若干基本物理性质研究
完成人：赵忠贤(中国科学院物理研究所)，陈仙辉(中国科学技术大学)，王楠林(中国科学院物理研究所)，闻海虎(中国科学院物理研究所)，方忠(中国科学院物理研究所)